
Треньорската кариера на Хубчев започва през 2008 г., когато той е назначен за треньор на втория отбор на Волфсбург в Регионаллигата. Същия сезон първият тим на Волфсбург става шампион на Германия.
След това поема Черноморец (Поморие) по покана на Красимир Балъков, който по това време ръководи Черноморец (Бургас), а Поморие е сателитен тим. С младата формация Хубчев стига до финал за Купата на България, който губи с 1:0 от Берое. По пътя си отстранява Ботев (Криводол), Дунав (Русе), Ботев (Враца), Миньор (Перник) и Калиакра (Каварна). През следващия сезон довежда отбора до бараж за влизане в "А" група. На 12 юни отборът му побеждава с 3:0 сегашния участник в "А" група Видима-Раковски (Севлиево) в Сливен, но три дни по-късно Лицензионната комисия на БФС отказва да издаде лиценз за "А" ФГ на спечелилия баража Черноморец (Поморие), завършил 2-и в Източна "Б" ФГ, на основание "липсата на представени доказателства от клуба за наличието на несвързани лица в управлението" на Черноморец (Поморие) и Черноморец Бургас (Бургас), състезаващ се в "А" група.
През лятото на 2011 г. Хубчев е назначен за старши-треньор на "Ботев" (Пловдив), но няколко месеца по-късно след неубедителни резултати е освободен от поста, а на негово място е назначен Милен Радуканов.